Με ομόφωνη απόφαση, το Τριμελές Εφετείο Πλημμελημάτων έκρινε ενόχους τον πατέρα Αντώνιο και τέσσερις πρώην συνεργάτες του για κακοποιητικές συμπεριφορές σε δομές της Κιβωτός του Κόσμου, ενώ δύο ακόμη κατηγορούμενοι απαλλάχθηκαν από το σύνολο των κατηγοριών. Οι καταδικασθέντες δεν παρέστησαν στο ακροατήριο κατά την εκφώνηση της απόφασης.
Το δικαστήριο έκρινε ότι, κατά περίπτωση, στοιχειοθετούνται αδικήματα σωματικών βλαβών –απλών, βαριών και επικίνδυνων– καθώς και ηθικής αυτουργίας σε αυτές, κατηγορία που αποδόθηκε στον πατέρα Αντώνιο. Παράλληλα, πρώην εργαζόμενοι κρίθηκαν ένοχοι και για απειλή και έκθεση. Ο ιδρυτής της οργάνωσης καταδικάστηκε συνολικά για εννέα πράξεις που αφορούν βαριές και απλές σωματικές βλάβες, τόσο ως φυσικός όσο και ως ηθικός αυτουργός.
Σύμφωνα με την απόφαση, οι κατηγορούμενοι κρίθηκαν ένοχοι για περισσότερες πράξεις σε σχέση με την πρωτόδικη κρίση. Οι υποθέσεις αφορούσαν περιστατικά ξυλοδαρμών, καταναγκαστικής εργασίας, επιβολής τιμωριών και απομόνωσης ανηλίκων, που φέρονται να έλαβαν χώρα σε δομές στον Βόλο, την Αθήνα και την Καλαμάτα. Αντίθετα, για περιστατικά που αποδίδονταν σε δομή της Χίου, οι κατηγορούμενοι αθωώθηκαν, ενώ υπήρξαν και επιμέρους απαλλαγές για συγκεκριμένες πράξεις.
Μετά την ανακοίνωση της ετυμηγορίας, δύο από τους καταδικασθέντες ζήτησαν την αναγνώριση ελαφρυντικών, επικαλούμενοι αφενός καλή συμπεριφορά μετά την πράξη και αφετέρου ότι τελούσαν υπό την επιρροή του πατέρα Αντώνιου. Όπως υποστήριξε συνήγορος υπεράσπισης, ο εντολέας του «τελούσε υπό την επήρεια του πατέρα Αντώνιου» και θεωρούσε ότι ενεργούσε προς όφελος των παιδιών, χωρίς πρόθεση εκδίκησης.
Η εισαγγελέας της έδρας εισηγήθηκε να αναγνωριστεί το ελαφρυντικό της καλής συμπεριφοράς μετά την πράξη, απορρίπτοντας ωστόσο τον ισχυρισμό περί μη ταπεινών αιτίων. Όπως ανέφερε, η χρήση βίας και πρακτικών απομόνωσης σε βάρος ανηλίκων δεν μπορεί να εκληφθεί ως παιδαγωγικό μέτρο, επισημαίνοντας ότι τέτοιες πρακτικές αντίκεινται ευθέως στις αρχές της παιδαγωγικής επιστήμης και στην κοινή αντίληψη περί προστασίας των παιδιών.
